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干貨!美國化學(xué)會發(fā)布深度報告,盤點新型冠狀病毒潛在療法

日期:2020-03-16
隨著導(dǎo)致COVID-19的新型冠狀病毒在世界范圍的廣泛傳播,它對人類健康的潛在威脅也愈發(fā)嚴(yán)重??茖W(xué)家和研發(fā)人員一直在與病毒賽跑,以期盡快了解這一新型病毒,并開發(fā)防治它的有效療法和疫苗。為了支持當(dāng)前的研發(fā)活動,美國化學(xué)會(American Chemistry Society, ACS)近日發(fā)布了一篇深度報告,對已經(jīng)發(fā)布的與冠狀病毒研發(fā)相關(guān)的科學(xué)信息進行了深度盤點。


這篇報告不但描述了多種“老藥新用”的候選療法,還基于與冠狀病毒研究相關(guān)的專利信息,對研發(fā)早期的小分子化合物、抗體、細胞因子、RNA療法,以及疫苗進行了盤點,可謂干貨滿滿。作者表示,這一報告中的信息為正在進行的療法和疫苗研發(fā)活動提供了堅實的知識基礎(chǔ)。今天,藥明康德內(nèi)容團隊將與讀者分享這篇報告關(guān)于潛在療法的主要內(nèi)容。


冠狀病毒感染中的關(guān)鍵蛋白和它們的功能


發(fā)現(xiàn)靶點是開發(fā)具有高度靶點特異性的藥物和/或“老藥新用”治療新冠病毒感染的重要一步。下面的表格列舉了冠狀病毒感染過程中的潛在靶點,它們在病毒感染中的作用,以及針對這些靶點的一些代表性已有療法或候選療法。

藥明康德內(nèi)容團隊制圖(點擊可見大圖)
3CLpro和PLpro是兩種病毒蛋白酶,它們在將病毒多肽切割為功能性單位,協(xié)助病毒在細胞內(nèi)復(fù)制和包裝過程中起到重要作用。多種抗HIV藥物靶向這一機制,例如洛匹那韋和利托那韋。

RdRp是負責(zé)病毒RNA合成的RNA聚合酶,它能夠被已有的抗病毒藥物和候選藥物阻斷,其中包括瑞德西韋。


病毒S蛋白和宿主ACE2受體的相互作用,引發(fā)細胞通過內(nèi)吞將病毒吞入細胞內(nèi)。廣譜抗病毒藥物阿比多爾旨在防治病毒進入宿主細胞,在治療流感方面已經(jīng)產(chǎn)生了療效。


宿主產(chǎn)生的TMPRSS2蛋白酶在對S蛋白的蛋白水解處理過程中起到重要作用,它能夠促進S蛋白與ACE2受體結(jié)合。在體外試驗中,已經(jīng)在臨床試驗中得到驗證的TMPRSS2抑制劑甲磺酸卡莫司他能夠阻斷新冠病毒進入人類細胞。


ACE2除了作為新冠病毒入侵的受體以外,還對調(diào)節(jié)血壓和體內(nèi)液體和電解質(zhì)平衡具有重要作用。ACE2催化血管緊張素II(angiotensin II)降解為血管緊張素(angiotensin)。血管緊張素II通過與AT1受體結(jié)合,起到收縮血管的作用,而血管緊張素通過與AT2受體結(jié)合,起到舒張血管的作用。血管緊張素II和血管緊張素之間的平衡至關(guān)重要。靶向這些靶點的候選藥物(例如L-163491:部分AT1受體結(jié)合劑和部分AT2受體激動劑)可能緩解新冠病毒導(dǎo)致的肺部損傷。


與關(guān)鍵靶點蛋白相關(guān)的專利和候選藥物



通過對美國化學(xué)會的專利數(shù)據(jù)庫和化合物數(shù)據(jù)庫的搜索,研究人員發(fā)現(xiàn)多項與上述關(guān)鍵性蛋白相關(guān)的專利和治療性化合物。其中,3CLpro和RdRp兩個靶點吸引了更多研發(fā)人員的關(guān)注,靶向它們的潛在化合物也更多。這可能是因為SARS冠狀病毒也包含3CLpro和RdRp。



治療COVID-19的“老藥新用”



由于新冠病毒是一種新發(fā)現(xiàn)的病原體,目前尚沒有針對它的特異性藥物。因此,“老藥新用”成為短期內(nèi)一種經(jīng)濟和有效的療法開發(fā)策略?;谛鹿诓《镜幕蚪M序列以及蛋白結(jié)構(gòu),研發(fā)人員正在迅速嘗試一系列已有藥物治療COVID-19患者的療效。下面的表格總結(jié)了這些藥物的信息,以及它們活性的潛在機制。


鑒于“老藥新用”已經(jīng)在多篇文章中進行過介紹,本文不再贅述。


相關(guān)閱讀:


研發(fā)管線中靶向關(guān)鍵蛋白靶點的小分子化合物



除了多種商業(yè)化的抗病毒藥物以外,目前處于研發(fā)階段的很多小分子化合物針對SARS和MERS病毒的多種關(guān)鍵蛋白產(chǎn)生了顯著的抑制效果。這些候選藥物大多抑制病毒蛋白酶或RdRp。由于新冠病毒和SARS冠狀病毒具有高水平的相似性。這些化合物可能可以用于治療新冠病毒感染。其中包括,benzopurpurin B, C-467929, C-473872, NSC-306711 和N-65828。N-65828是一款名為NSP15的病毒核糖核酸內(nèi)切酶抑制劑,在細胞培養(yǎng)中能夠降低SARS病毒的感染能力。

研發(fā)管線中靶向關(guān)鍵靶點的部分小分子化合物(圖片來源:參考資料[1])

化合物C21和CGP-42112A是兩種AT2受體激動劑。L-163491具有雙重作用,是AT2受體的部分激動劑和AT1受體的部分拮抗劑。


發(fā)現(xiàn)其它小分子化合物的策略



除了上述這些化合物以外,可能還有其它小分子化合物具有對冠狀病毒的潛在治療和藥理活性。

基于上述化合物,研究人員對CAS化合物注冊庫進行篩選,他們發(fā)現(xiàn)了與上述化合物具有60%結(jié)構(gòu)相似性,并且符合里賓斯基五規(guī)則(Lipinski’s rule of 5)的小分子化合物。下面的表格列舉了其中部分同時標(biāo)注了特定藥理學(xué)活性或者治療用途的化合物。


圖片來源:參考資料[1]
雖然這些化合物需要更多研究來證明它們的效果,但是這一搜索方式展現(xiàn)了一種快速發(fā)現(xiàn)COVID-19潛在療法的策略。


治療冠狀病毒相關(guān)疾病的生物制品



使用生物制品能夠拓寬治療COVID-19的治療選擇,并且利用SARS和MERS爆發(fā)時積累的研究經(jīng)驗?;趯AS數(shù)據(jù)庫的搜索,研究人員發(fā)現(xiàn)超過500項專利申請,描述使用四種不同生物制品治療或預(yù)防SARS和MERS。其中疫苗開發(fā)最多(363項),然后是治療性抗體(99項),干擾RNA(35項)和細胞因子(22項)
抗體

99項抗體專利中描述了治療/診斷SARS和MERS的抗體信息。其中23項為SARS特異性抗體,17項為MERS特異性抗體,21項為診斷用抗體。下面的表格列舉了在研SARS病毒治療性抗體的靶點分析。結(jié)果表明超過90%的抗體靶向病毒的S蛋白(包括受體結(jié)合域)。這些數(shù)據(jù)顯示,S蛋白是開發(fā)新冠病毒抗體的一個潛在靶點。


治療SARS的潛在抗體療法分析(圖片來源:參考資料[1])


另外有38項專利涉及其它抗病毒抗體,它們可能在治療SARS或MERS時產(chǎn)生作用。這包括靶向IL-6/IL-6R,TLR3, CD16, ITAM, DC-SIGN, ICAM-3,IP-10/CXCL10, MCP·1等細胞因子和趨化因子的抗體。細胞因子風(fēng)暴被認為和COVID-19患者的疾病嚴(yán)重程度相關(guān)。收入重癥監(jiān)護室(ICU)的患者通常促炎癥細胞因子水平升高。靶向這些因子的抗體可能降低患者的炎癥反應(yīng)。



圖片來源:123RF


細胞因子
細胞因子是介導(dǎo)對病原體的免疫反應(yīng)的小分子量蛋白。不同細胞因子的生產(chǎn)水平對機體消滅入侵病原體的能力至關(guān)重要。在病毒感染時,機體生成的最顯著的細胞因子是干擾素(IFNs),它們可以影響病毒的復(fù)制。因為這一功能,干擾素和干擾素融合蛋白在過去20年中被用于治療病毒感染。研究人員發(fā)現(xiàn),有不少專利涉及使用干擾素治療SARS感染,其中包括重組干擾素,IFN-ω,IFN-λ1,2,3,和干擾素-人類血清白蛋白(albumin)融合蛋白。

RNA療法

RNA干擾(RNAi)是一種天然的生物過程,小段RNA序列通過域mRNA上的特定序列互補結(jié)合,能夠抑制基因的表達或轉(zhuǎn)譯。自從RNAi現(xiàn)象在上世紀(jì)90年代被發(fā)現(xiàn)以來,它成為一種靜默/抑制與病毒毒性和病理發(fā)生相關(guān)基因的常見手段。CAS數(shù)據(jù)庫中有35項專利涉及使用RNAi治療SARS感染。其中28項專利使用siRNA,3項使用反義寡核苷酸(ASO)。siRNA的優(yōu)勢在于可以靶向與病毒相關(guān)的多種基因,已有專利中開發(fā)的siRNA靶向的病毒基因包括S,M,N,E基因以及編碼RNA聚合酶的基因等。


結(jié)語


作者表示,COVID-19疫情的爆發(fā)再次證明,RNA病毒通過變異和遺傳重組,以及跨物種傳播,能夠?qū)κ澜缛嗣竦慕】诞a(chǎn)生嚴(yán)重威脅。即使經(jīng)歷過SARS和MERS的爆發(fā),世界仍然缺乏控制目前COVID-19疫情爆發(fā)的有效手段。


我們必須協(xié)力開發(fā)治療已有和未來潛在冠狀病毒感染的有效藥物和疫苗,這樣才能降低它們對全球健康系統(tǒng)和人類生命的影響。由于時間緊迫,目前“老藥新用”成為治療COVID-19的主要手段。然而,長期的藥物開發(fā)目標(biāo)應(yīng)該包括能夠?qū)Σ煌跔畈《井a(chǎn)生廣譜療效的治療方法,以及緩解疾病癥狀,防治死亡的手段。這一報告中列舉的潛在藥物,可能成為未來藥物開發(fā)的起點。
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